La fiebre amarilla es una enfermedad endémica en América y África, entre el paralelo 15 norte y el paralelo 10 sur.
La incidencia es mayor en las áreas de la sabana de África central y occidental, durante la fase tardía de la temporada de lluvias y la fase inicial de la estación seca, con epidemias ocasionales en las zonas urbanas y en las aldeas. La Organización Mundial de la Salud estima que se producen 200.000 casos por año en el continente africano.
Por otra parte, en América Central y del Sur, algunas regiones ecuatoriales y tropicales son endémicas: los episodios son esporádicos (serían 100-200 casos por año) y ocurren principalmente durante la temporada cuando se registra el pico de precipitación; Muy raros son los casos de turistas infectados.
